วิธีใหม่ที่เร็วและมีประสิทธิภาพสำหรับในการสร้างโปรไฟล์ของเซลล์โดดเดี่ยว

หลายเซลล์ในร่างกายของพวกเราดำเนินการในลักษณะปิดบังวิทยาศาสตร์ที่ยังไม่เข้าใจ ที่ยังไปสำหรับเซลล์ภูมิต้านทานที่มีความจำเป็นในการปกป้องเราจากโรคร้ายแรง

เพื่อจะเอาชนะอุปสรรคนี้นักวิจัยมานะอย่างมากสำหรับในการหาวิธีใหม่ในการศึกษาเรียนรู้ผลงานด้านในของเซลล์แต่ละเซลล์

ความท้าทายเป็นไม่เพียงแค่ แต่จะแยกเซลล์ออกจากแบบอย่างเนื้อเยื่อยิ่งไปกว่านี้เรายังควรต้องหาวิธีการวิเคราะห์ลักษณะการทำงานของเซลล์แต่ละเซลล์ด้วย” ดร. เคดาร์ทุ่งนาธานที่นาลำธารผู้ช่วยศาสตราจารย์และก็หัวหน้างานวิจัยภาควิชาชีวเคมีและก็ชีววิทยาระดับโมเลกุลกล่าว มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นเดนมาร์ก

ในการศึกษาใหม่นำโดย Kedar Nath Natarajan และก็ Xi Chen จากสถาบัน Wellcome Sanger Institute ทีมงานวิจัยได้ปรับปรุงกรรมวิธีการใหม่สำหรับการทำเป็นชิ้นเล็กชิ้นเล็กข้างในอวัยวะรวมทั้งเยื่อของกล้องจุลทรรศน์

กรรมวิธีการใหม่ช่วยทำให้พวกเขาสามารถวิเคราะห์เซลล์ได้มากกว่า 3000 เซลล์จากม้ามซึ่งเป็นจุดที่มีฮอตปอสำหรับเซลล์ภูมิคุ้มกันทุกชนิด เซลล์ที่ต่อสู้กับการติดเชื้อ แต่ยังทำให้ภูมิต้านทานในชีวิตประจำวันและก็การโต้ตอบ

กระบวนการใหม่ๆได้รับการพัฒนาอย่างสม่ำเสมอเพื่อแสดงรายละเอียดของเซลล์ผู้เดียวข้างในอวัยวะรวมทั้งเนื้อเยื่อ วิธีการเป็นการเล่าเรียนรูปแบบพื้นฐานของสิ่งมีชีวิตยกตัวอย่างเช่น DNA แล้วก็ขั้นตอนการบรรจุด้านในเซลล์เดียว บรรจุภัณฑ์นี้เรียกว่า chromatin และก็สัญญาณที่ยีนภายในพิมพ์เขียวถูกเปิดแล้วก็ปิดด้วยเหตุผลดังกล่าวก็เลยพินิจพิเคราะห์ว่าจะเปลี่ยนเป็นเซลล์เม็ดเลือดเซลล์ผิวหนังเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์ของมะเร็งหรือเซลล์จำพวกอื่น

กรรมวิธีใหม่ของพวกเราสำหรับการทำให้โครเมียมด้านในเซลล์เดียวมีทางเลือกที่มีประสิทธิภาพสามารถปรับขนาดได้และถูกกว่าสำหรับวิธีการที่ทันสมัยที่สุดซึ่งจึงควรมีองค์ประกอบเบื้องต้นที่มีราคาแพงอุปกรณ์พิเศษและอุปกรณ์ต่างๆ” นายติดอยู่เดรนาธัตนานันกล่า

ร่วมกับผู้เขียน Xi Chen คนแรกจากสถาบัน Wellcome Sanger Institute เขาเป็นผู้นำในการพัฒนาแนวทางการใหม่ๆรวมทั้งสร้างรายละเอียดเกี่ยวกับเซลล์ต่างๆอาทิเช่นเซลล์ภูมิต้านทานเซลล์ต้นกำเนิดเป็นต้นผู้ร่วมวิจัยจากสถาบัน Wellcome Sanger ตัวอย่างเช่น Ricardo J Miragaia และงานนี้ได้รับการปฏิบัติการในห้องทดลองของนักเขียน Sarah A Teichmann ที่เกี่ยวพัน

บทสรุปย่อของกระดาษให้คำชี้แจงนี้:

การตรวจค้นลำดับเบสของ transposase-chromatography (ATAC-seq) ใช้กันอย่างมากมายเพื่อเจาะจงขอบเขตของกฎข้อปฏิบัติทั่วอีกทั้งจีโนม แม้กระนั้นการศึกษาเล่าเรียนปริมาณน้อยได้รับการดำเนินการในระดับเซลล์ผู้เดียว(scATAC-seq) เพราะเหตุว่าความท้าทายทางด้านเทคนิค ตรงนี้พวกเราได้พัฒนากรรมวิธี scATACseq ที่เรียบง่ายและก็มีประสิทธิภาพโดยใช้การรวมแท็ก Tn5 ที่มีการจัดsingle-nuclei เราชี้ให้เห็นว่าขั้นตอนการของพวกเราสามารถดำเนินการได้อย่างสะดวกในระบบต่างๆและเซลล์ที่สดแล้วก็รักษาได้จากเนื้อเยื่อหลัก โดยการทำโปรไฟล์มากยิ่งกว่า 3,000 splenocytes พวกเราจะกำหนดชนิดของเซลล์ภูมิต้านทานที่ไม่เหมือนกันออกไปและแสดงขอบเขตการกำกับดูแลเฉพาะที่เกี่ยวกับเซลล์และต้นสายปลายเหตุการถอดรหัสที่เกี่ยวโยง

Facebook Comments